3130简明使用手册内容摘要:
一个纯荧光除在它自己光谱的中心波长处能采 集到信号 N1外,在其他荧光信号光谱的中心波长处亦能检测到信号而产生信 号重叠。 为了校准信号重叠,需知道一种荧光信号在其他荧光信号处产生的重叠系数。 所以,我们用四(或五)条不同长度的DNA片断分别标记上不同的荧光素来计算这些系数。 最后得到一个4x4(或5x5)的数据矩阵。 AppliedBiosystems 3130简明使用手册 第 13 页 共 32 页 何时作光谱校正。 使用新的荧光染料 激光或 CCD被调节或更换后 不同颜色的荧光间出现干扰(有拔起或下压峰) 参数的改变(荧光类型,毛细管类型和毛细管长度) 如何作光谱校正。 两种类型的校正标准样品 AppliedBiosystems 3130简明使用手册 第 14 页 共 32 页 样品准备 按 照试剂盒说明书用HiDi甲酰 胺 混合校正标准样品 震荡离心 95度变性 5分钟后 立即冰浴 2分钟 震荡离心 在 样品 板中加入样品( 96孔板加 10ul, 384孔板加 5ul) 用橡胶垫装配样品板,装配后橡胶垫必须平整,样品板上的孔与橡胶垫上的孔要对齐,如图 橡胶垫未对齐样品孔 橡胶垫未对齐样品孔 橡胶垫未对齐样品孔 橡胶垫对齐了样品孔 短甩离心, 1500g X 5s 确认所有孔的样品都在底部 ,如右图 按下图组装样品板 样品在底部 样品板固定器 橡胶垫 样品板 样品板基座 组装好的样品板 AppliedBiosystems 3130简明使用手册 第 15 页 共 32 页 注意。 固 定器与橡胶垫的孔一定要对齐, 否则会损毁毛细管。 固定器与橡胶垫的孔 没有对齐 创建光谱校正用的 protocol 选择 GA Instruments ga3130 Protocol Manager. 在 Instruments Protocols界面中点击 New按钮 在 Name中为 Protocol命名 在 Type下拉菜单中选择Spectral 依次选择正确的 DyeSet、Polymer、 Array Length、 Chemistry和 Run Module,点击 OK。 AppliedBiosystems 3130简明使用手册 第 16 页 共 32 页 创建光谱校正板 选择 GA Instruments ga3130 instrument name Plate Manager. 点击 New按钮,在弹出窗口中分别输入以下信息 样品板名字 可选项:样品板的相关描述 选择 Spectral Calibration 选择 96well 输入所有者的名字 输入操作者的名字 点击 OK按钮 在 Spectral Calibration Plate Editor dialog界面中,输入以下信息 AppliedBiosystems 3130简明使用手册 第 17 页 共 32 页 样品名 相关信息 前面创建的 Protocol 点击 OK按钮,则一个样品板记录创建完成 运行光谱校正板 : 选择 GA Instruments ga3130 instrument name Run Scheduler. 将样品板放到自动进样器上,注意板的方向,此时 RunScheduler界面中板的指示块由灰色变为黄色 AppliedBiosystems 3130简明使用手册 第 18 页 共 32 页 点击 FindAll按钮,找到光谱校正的样品板的文件名 点击该文件名后,再点击黄色的板的指示块, 此时,指示块将右黄色变为绿色 在 DC软件的工具栏中,点击 ,在随后的对话框 中点击 OK来开始运行 确认光谱校正成功 /失败状态 选择 GA Instruments ga3130 instrument name Instrument Status Event Log. 查看各道毛细管的状态 ,如下图 相关标准 毛细管位置 是否成功 Q值 Condition number 查看光谱校正结果 选择 GA Instruments ga3130 instrument name Spectral Viewer. 在 Dye Set下拉菜单中,选择相应的荧光染料 在样品板图上选择某个孔来查看其光谱校正结果 Dye Set Z AppliedBiosystems 3130简明使用手册 第 19 页 共 32 页 Dye Set E DS33(G5) 故障排除 AppliedBiosystems 3130简明使用手册 第 20 页 共 32 页 症状 可能原因 解决方法 无信号 样品预处理 问题 更换样品,使用新的 HIDI甲酰氨 样品板中有 气泡 离心 光谱校正失败或显示“ No candidate spectral files found” 毛细管阻塞 手工命令灌胶,观察毛细管在阴极的喷胶情况来判断其是。3130简明使用手册
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