海岛棉抗黄萎病相关基因gbeds1的克隆与生物信息学分析本科毕业论文(编辑修改稿)内容摘要:

b) 对基因信号肽及跨膜域的预测; c) 蛋白质模体分析; d) 亚细胞定位; e) 序列同源性分析。 (3)基于生物信息学的分析,对所克隆的基因进行 功能的预测。 2 研究内容 (1) GbEDS1 基因的克隆。 a)棉花总 RNA 的提取与 cDNA 的合成; b) GbEDS1 基因的克隆和序列分析。 (2) GbEDS1 基因的蛋白分析。 a) GbEDS1 基因的氨基酸序列分析; b) GbEDS1 的亲疏水性分析; c) GbEDS1 的信号肽分析。 (3) GbEDS1 序列与其他物种 EDS1 同源比对分析。 进度安排: : 查找国内外相关文献,学习与本试验有关的实验技术, 制定实验方案。 : 提取棉花总 RNA,获得质量较高的 RNA,进行 cDNA 的片段合成。 : 设计并合成相关引物,扩增棉花相关基因 GbEDS1 及全长 ORF,克隆并测序。 :对基因进行生物信息学的分析,从而预测基因的功能。 :整理实验材料,撰写论文,准备答辩。 指导教师意见: 论文选题针对性强,试验材料有代表性,试验方案可行,预期结果明确,同意开题。 指导教师: 2020年 9 月 30 日 审 核 小 组 成 员 姓 名 职 称 备 注 姓 名 职 称 备 注 王省芬 教授 李文龙 讲师 刘立峰 教授 李志坤 副教授 李喜焕 副教授 开题报告记录: 棉花 RNA 提取过程如何防止其降解。 基因克隆过程中如何避免基因组的干扰。 审核小组评语: 论文选题依据比较充分,试验设计比较合理,研究方法可行,工作量较大,研究结果对于棉花黄萎病抗性的改良具有一定理论意义和应用前景。 同意进入下一阶段的试验。 审核小组组长:(签字) 2020年 10 月 20 日 学院意见: 院长: 年 月 日 河北农业大学本科毕业论文指导教师评阅书 学 生姓名: 刘通 学 号: 2020014010216 专业班级:农学 0902 所在学院:农学院 论文题目:海岛棉抗黄萎病相关基因 GbEDS1 的克隆与生物信息学分析 指导教师评语: 该同学遵守学校的各项规章制度,对工作认真负责,能够较好的完成各项实习任务。 学习态度端正,具有较为扎实的生物科学基础理论和专业知识。 论文对棉花抗黄萎病相 关基因 GbEDS1 的克隆与生物信息学分析进行了研究,论文选题针对性强,依据 充分 ,具有一定的科学意义和应用价值。 试验设计科学合理, 研究方法可行, 符合本科论文要求。 论文写作格式规范,条理清晰,层次分明,数据可靠,结果分析透彻,文献参考得当,符合一般科技论文写作要求。 该生在做毕业论文的研究过程中基本掌握了本学科领域的基础理论和专业知识。 论文不足之处在于: ( 1)前言部分过于繁琐,可以删去与研究内容相关不大的部分; ( 2)文章参考文献格式尚需进一步修改; 成 绩 评 定: 是否同意答辩: 指导教师(签名): 年 月 日 河北农业大学 本科毕业论文答辩评分表 评分指标 分 值 评 价 内 容 得 分 论文选题 10 选题有重要理论意义或实用价值。 立题依据充分。 文献引用 12 阅读、引用文献资料较广泛,较全面了解本领域学术动 态,综合分析能力较强。 论文难度 及工作量 14 难度较大,工 作量大。 论文成果 的创新性 12 有独到见解,有较大的创新性成果。 理论基础与科研能力 16 具有坚实的基础理论和系统的专门知识,具有较强 的 独立从事科研工作的能力,研究方法和技术体系得当。 写作能力 16 条理清楚,层次分明,说理透彻,文笔流畅,表格、绘图准确规范,中外文摘要简明扼要,语句通顺,语法正确,符合科技写作规范。 答辩报告 10 能简明扼要、重点突出地阐述论文或设计的主要内容,有新见解,结论明确;时间掌握恰当。 回答问题 10 思维敏捷,逻辑性强,准确流利地回答各种问题。 总 分 100 注:本表为答辩小组成员评分用表,评分标准参照《河北农业大学毕业论文质量评定参考标准》 河北农业大学 2020 届本科毕业论文答辩记录表 所在学院:农学院 专业班级: 农学 0902 时间: 2020 年 6 月 6 日 学 生 姓 名 刘通 学 号 2020014010216 指导教师姓名 张艳 职 称 讲师 毕业论文题目: 海岛棉抗黄萎病相关基因 GbEDS1 的克隆与生物信息学分析 答 辩 小 组 成 员 姓 名 职 称 成 绩 姓 名 职 称 成 绩 王省芬 教授 李志坤 副教授 刘立峰 教授 李喜焕 副教授 李文龙 讲师 答辩小组评语: 答辩小组组长:(签字) 2020年 6 月 6 日 答 辩 成 绩: 河北农业大学 本科毕业论文 (设计 ) 题 目: 海岛棉抗黄萎病相关基因 GbEDS1 的克隆 与生物信息学分析 学 院: 农 学 院 专业班级: 农学 0902 班 学 号: 2020014010216 学生姓名: 刘 通 指导教师 姓名 : 张 艳 指导教师 职称 : 讲 师 二 O 一三 年 六 月 一 日 海岛棉抗黄萎病相关基因 GbEDS1 的克隆 与生物信息学分析 农学专业 刘通 摘要 :本研究根据不同物种的 EDS1 核酸保守区域设计简并引物,利用 RTPCR 和RACE 技术从海岛棉克隆抗黄萎病相关基因 EDS1 的 cDNA及开放阅读框序列( Open reading frame, ORF)。 GbEDS1 cDNA 全长 2190bp,其中 5′非编码区 168bp, 3′非编码区 174bp, ORF 为 1848bp,编码 615 个氨基酸。 GbEDS1 基因核酸序列与毛果杨EDS1(XM002322106)具有 64%的 同源性,该基因内部无信号肽结构。 关键词 : 棉花。 抗黄萎病。 GbEDS1。 克隆。 生物信息学分析 Molecular Cloning and Bioinformatics Analysis of GbEDS1 Related with Verticillium Wilt Resistance from Gossypium barbadense Author:Liu Tong Major: Agronomy Abstract: Degenerate primer was designed according to conserved domains of Enhanced Disease Susceptibility1 (EDS1) from different species. Opening reading frame and cDNA sequences of GbEDS1 related to Verticillium wilt resistance was isolated by RTPCR and RACE technologies. The 2190bp cDNA sequence of GbEDS1 contained a 168bp 5′UTR and a 174bp 3′UTR, as well as an open reading frame of 1848bp encoding a 615 amino acids. The identity of the nucleotides between GbEDS1 and EDS1 of poplar (XM002322106) was 64%. No signal peptide was in the amino acid sequence. Keywords: Cotton。 Verticillium wilt resisitance。 GbEDS1。 Clone。 Bioinformatics Analysis 棉花是世界上重要的经济作物,据估计,棉花创造的年产值达 18002020 亿美元,全世界有 18 亿人口 以种植棉花为生 [1]。 棉花在整个生长过程中都受到病害的威胁,而。
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